Protein–RNA interactions for Protein: Q1AE95

TMEM183B, Transmembrane protein 183B, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM183BQ1AE95 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM183BQ1AE95 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM183BQ1AE95 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms