Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL8BQ17RB0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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RTL8BQ17RB0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RTL8BQ17RB0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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