Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PFKFB3Q16875 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PFKFB3Q16875 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFKFB3Q16875 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFKFB3Q16875 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFKFB3Q16875 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PFKFB3Q16875 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
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