Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRNQ16849 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRNQ16849 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRNQ16849 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRNQ16849 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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