Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UPP1Q16831 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms