Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRNP35Q16560 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms