Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VAMP3Q15836 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
VAMP3Q15836 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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