Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
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