Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SF3A1Q15459 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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