Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDK1Q15118 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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