Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PDCD1Q15116 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PDCD1Q15116 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms