Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KARSQ15046 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KARSQ15046 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KARSQ15046 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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