Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAB3GAP1Q15042 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAB3GAP1Q15042 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
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