Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPNMBQ14956 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPNMBQ14956 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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