Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MDC1Q14676 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MDC1Q14676 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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