Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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UBE4AQ14139 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE4AQ14139 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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