Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CNGB1Q14028 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNGB1Q14028 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNGB1Q14028 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms