Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCINQ13939 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCINQ13939 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCINQ13939 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCINQ13939 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCINQ13939 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCINQ13939 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCINQ13939 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCINQ13939 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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