Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOFQ13790 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOFQ13790 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOFQ13790 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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