Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PMS2P11Q13670 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PMS2P11Q13670 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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PMS2P11Q13670 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PMS2P11Q13670 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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