Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL4BQ13620 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CUL4BQ13620 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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