Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PKD2Q13563 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PKD2Q13563 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PKD2Q13563 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
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