Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SNTA1Q13424 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SNTA1Q13424 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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