Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAPPAQ13219 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PAPPAQ13219 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms