Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NR1H3Q13133 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NR1H3Q13133 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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