Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUSP4Q13115 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DUSP4Q13115 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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