Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GRIK2Q13002 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GRIK2Q13002 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GRIK2Q13002 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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GRIK2Q13002 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GRIK2Q13002 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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