Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CSTF3Q12996 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CSTF3Q12996 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
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