Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ANK3Q12955 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ANK3Q12955 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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