Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CHD3Q12873 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CHD3Q12873 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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