Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
BPTFQ12830 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BPTFQ12830 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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