Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SMARCB1Q12824 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SMARCB1Q12824 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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