Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
TROQ12816 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
TROQ12816 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
TROQ12816 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
TROQ12816 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
TROQ12816 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
TROQ12816 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
TROQ12816 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
TROQ12816 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TROQ12816 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TROQ12816 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TROQ12816 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TROQ12816 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
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