Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCAPQ12770 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SCAPQ12770 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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