Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HMGXB3Q12766 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
HMGXB3Q12766 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HMGXB3Q12766 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
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