Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RPO41YFL036W 4056 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PSP1YDR505C 2526 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RAV2YDR202C 1056 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RSM28YDR494W 1086 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SPT2YER161C 1002 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPL1BYGL135W 654 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YGL214WYGL214W 486 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YIP1YGR172C 747 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 PEX18YHR160C 852 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YLR416CYLR416C 399 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YML037CYML037C 1023 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 IRC21YMR073C 606 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPL1AYPL220W 654 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 VAS1YGR094W 3315 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SLF1YDR515W 1344 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YPL150WYPL150W 2706 nt3.11□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 APC5YOR249C 2058 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SLU7YDR088C 1149 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YDR209CYDR209C 414 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 HTA1YDR225W 399 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SMT3YDR510W 306 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 BUD19YJL188C 309 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 IME1YJR094C 1083 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YKL069WYKL069W 543 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YKR011CYKR011C 1062 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 RPL15AYLR029C 615 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 SLP1YOR154W 1764 nt3.1□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 ADY4YLR227C 1482 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 CDC55YGL190C 1581 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 HRD1YOL013C 1656 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YDR029WYDR029W 315 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YFH7YFR007W 1062 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 EMC4YGL231C 573 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 TSR4YOL022C 1227 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YOR283WYOR283W 693 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt3.09□□□□□ -1.91
LSP1Q12230 ITT1YML068W 1395 nt3.09□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 PDR1YGL013C 3207 nt3.09□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 CYR1YJL005W 6081 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 TPO5YKL174C 1857 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 OCA6YDR067C 675 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YEL075CYEL075C 369 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 DSE2YHR143W 978 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 AFT2YPL202C 1251 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YPR053CYPR053C 456 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 TOM1YDR457W 9807 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 MRS2YOR334W 1413 nt3.08□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 CIK1YMR198W 1785 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 FLO11YIR019C 4104 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 VPS13YLL040C 9435 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SEC7YDR170C 6030 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 snR68snR68 136 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 CRD1YDL142C 852 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YER046W-AYER046W-A 330 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 IST3YIR005W 447 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SFT1YKL006C-A 294 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YKL070WYKL070W 510 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YLL044WYLL044W 447 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YLR400WYLR400W 474 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 RPL6BYLR448W 531 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 GIM3YNL153C 390 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YOL029CYOL029C 606 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 snR35snR35 204 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 MRD1YPR112C 2664 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SKT5YBL061C 2091 nt3.07□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 VBA4YDR119W 2307 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 HLR1YDR528W 1272 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 VMA5YKL080W 1179 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YKE2YLR200W 345 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 RPL19BYBL027W 570 nt3.06□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 CIN1YOR349W 3045 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 CTF13YMR094W 1437 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YCL020WYCL020W 1317 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YDL163WYDL163W 303 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 TMA20YER007C-A 546 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YGR039WYGR039W 312 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 RPA12YJR063W 378 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 GIM5YML094W 492 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YMR187CYMR187C 1296 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 INO4YOL108C 456 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 GRE2YOL151W 1029 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 GCY1YOR120W 939 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 TUM1YOR251C 915 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 YRO2YBR054W 1035 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 APD1YBR151W 951 nt3.05□□□□□ -1.92
LSP1Q12230 SHG1YBR258C 429 nt3.05□□□□□ -1.92
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