Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 RTG3YBL103C 1461 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 AGE1YDR524C 1449 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 PHO2YDL106C 1680 nt2.76□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SIR3YLR442C 2937 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 NOP12YOL041C 1380 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RIM1YCR028C-A 408 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RRT13YER066W 558 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YKL069WYKL069W 543 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YOL134CYOL134C 390 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RFC5YBR087W 1065 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SPO14YKR031C 5052 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 MAL33YBR297W 1407 nt2.75□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 FAA2YER015W 2235 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ARP5YNL059C 2268 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YER107W-AYER107W-A 321 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 THP2YHR167W 786 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YLR169WYLR169W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 KTI11YBL071W-A 249 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 COQ10YOL008W 624 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 snR191snR191 274 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 BNR1YIL159W 4128 nt2.74□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 BRE5YNR051C 1548 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SUL1YBR294W 2580 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 NUR1YDL089W 1455 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 MST27YGL051W 705 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 NOP19YGR251W 591 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YIL012WYIL012W 342 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 MRP49YKL167C 414 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 TDA8YAL064C-A 381 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 PIS1YPR113W 663 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YBR090CYBR090C 369 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 APA1YCL050C 966 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 PRP8YHR165C 7242 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YEL1YBL060W 2064 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 FUS1YCL027W 1539 nt2.73□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 STE6YKL209C 3873 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ATC1YDR184C 885 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 KEI1YDR367W 666 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 VAB2YEL005C 849 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YMR31YFR049W 372 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 OST5YGL226C-A 261 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 PPX1YHR201C 1194 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 CTK2YJL006C 972 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YLR339CYLR339C 552 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YMR187CYMR187C 1296 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YOL162WYOL162W 648 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 CRS5YOR031W 210 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 YOR385WYOR385W 873 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 ORC2YBR060C 1863 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SPB1YCL054W 2526 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 MSB2YGR014W 3921 nt2.72□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 SLK19YOR195W 2466 nt2.71□□□□□ -1.97
NFI1Q12216 RLI1YDR091C 1827 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 MRPL32YCR003W 552 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SLD5YDR489W 885 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 APC9YLR102C 798 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YKE2YLR200W 345 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 CWC24YLR323C 780 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RPL6AYML073C 531 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YRO2YBR054W 1035 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ARL1YBR164C 552 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YOR296WYOR296W 3870 nt2.71□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 PSD2YGR170W 3417 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RGC1YPR115W 3252 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 SRO77YBL106C 3033 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 NGG1YDR176W 2109 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 POL32YJR043C 1053 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 GPX1YKL026C 504 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YKL222CYKL222C 2118 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YOL107WYOL107W 1029 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 MSN1YOL116W 1149 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 HUA2YOR284W 732 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 NTC20YBR188C 423 nt2.7□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 TLC1TLC1 1301 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YHR213WYHR213W 597 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ATG27YJL178C 816 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YKR070WYKR070W 1059 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YAR062WYAR062W 597 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RPS30AYLR287C-A 192 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 GIM5YML094W 492 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 RRT16YNL105W 429 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 FPR1YNL135C 345 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YOL106WYOL106W 354 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 YPK1YKL126W 2043 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ILS1YBL076C 3219 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 ECM29YHL030W 5607 nt2.69□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 STT4YLR305C 5703 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 MLH1YMR167W 2310 nt2.68□□□□□ -1.98
NFI1Q12216 DNL4YOR005C 2835 nt2.68□□□□□ -1.98
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