Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 GIM3YNL153C 390 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPL23AYBL087C 414 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YPL107WYPL107W 747 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 STE23YLR389C 3084 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SNT1YCR033W 3681 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 CHA4YLR098C 1947 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ARK1YNL020C 1917 nt3.11□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 DUF1YOL087C 3351 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 OPI6YDL096C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPS21AYKR057W 264 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 VPS63YLR261C 327 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 RPS16AYMR143W 432 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SGT1YOR057W 1188 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 HUT1YPL244C 1020 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YJL132WYJL132W 2253 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YMR317WYMR317W 3423 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YDR338CYDR338C 2088 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 AVT2YEL064C 1443 nt3.1□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YHR080CYHR080C 4038 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 SHS1YDL225W 1656 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 snR5snR5 204 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YIR040CYIR040C 333 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 ECM9YKR004C 1134 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 YOL029CYOL029C 606 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 NIP7YPL211W 546 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 TIM12YBR091C 330 nt3.09□□□□□ -1.91
NMD4Q12129 MET10YFR030W 3108 nt3.09□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YKL075CYKL075C 1353 nt3.09□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 AI2Q0055 2565 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 BIT61YJL058C 1632 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 TMA64YDR117C 1698 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YNL193WYNL193W 1677 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YDL163WYDL163W 303 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PAU10YDR542W 363 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PAU11YGL261C 363 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YGR017WYGR017W 894 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 MCR1YKL150W 909 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RPL17AYKL180W 555 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CDC123YLR215C 1083 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PAU4YLR461W 363 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YBR062CYBR062C 543 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YPR153WYPR153W 423 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 ADY4YLR227C 1482 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PCK1YKR097W 1650 nt3.08□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 GLC3YEL011W 2115 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PRP38YGR075C 729 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RPL27AYHR010W 411 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DLS1YJL065C 504 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YNL043CYNL043C 321 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 NGL1YOL042W 1092 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YBR051WYBR051W 351 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 UBX3YDL091C 1368 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DBF20YPR111W 1695 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 TGL3YMR313C 1929 nt3.07□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 SOK1YDR006C 2706 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 STT4YLR305C 5703 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 VMA8YEL051W 771 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 CHO2YGR157W 2610 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YIL082WYIL082W 873 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YKL100CYKL100C 1764 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 ICR1ICR1 3199 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RPS28BYLR264W 204 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 VMA6YLR447C 1038 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YMR181CYMR181C 465 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YMR254CYMR254C 309 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RHO5YNL180C 996 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YNL235CYNL235C 432 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 SLP1YOR154W 1764 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YPR170CYPR170C 336 nt3.06□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 VTC4YJL012C 2166 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 MED1YPR070W 1701 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 VPS30YPL120W 1674 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 MAL33YBR297W 1407 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DTD1YDL219W 453 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DAD1YDR016C 285 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YIP5YGL161C 933 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 COX23YHR116W 456 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PEX18YHR160C 852 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YKL091CYKL091C 933 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 DAD2YKR083C 402 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YAR069CYAR069C 294 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 RPL20BYOR312C 519 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YAK1YJL141C 2424 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 TFB1YDR311W 1929 nt3.05□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 PFK26YIL107C 2484 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 YCK2YNL154C 1641 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 VHR2YER064C 1518 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 ARP4YJL081C 1470 nt3.04□□□□□ -1.92
NMD4Q12129 TMA20YER007C-A 546 nt3.04□□□□□ -1.92
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