Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC35.82■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ABCC8Q09428 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
ABCC8Q09428 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms