Protein–RNA interactions for Protein: Q08490

SGO1, Shugoshin, yeastyeast

Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGO1Q08490 SWF1YDR126W 1011 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 CPR5YDR304C 678 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YDR526CYDR526C 471 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YER068C-AYER068C-A 432 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RTT102YGR275W 474 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YLR101CYLR101C 396 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RAD33YML011C 534 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YBL028CYBL028C 321 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 ECM16YMR128W 3804 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RIM11YMR139W 1113 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 FMP23YBR047W 528 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 TPK2YPL203W 1143 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 MIP6YHR015W 1980 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 DAS1YJL149W 1992 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 PEP7YDR323C 1548 nt3.8□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YKR078WYKR078W 1758 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 SLK19YOR195W 2466 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YDR262WYDR262W 819 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YER181CYER181C 324 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YKL044WYKL044W 321 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 DAD2YKR083C 402 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 PAM18YLR008C 507 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YNL089CYNL089C 477 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 SWM2YNR004W 441 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 INO4YOL108C 456 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 VAM10YOR068C 345 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 SRL1YOR247W 633 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YPR197CYPR197C 564 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 TAF6YGL112C 1551 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 XRS2YDR369C 2565 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RDH54YBR073W 2877 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RSF2YJR127C 4143 nt3.79□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 HDA2YDR295C 2025 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 OAF3YKR064W 2592 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 YER135CYER135C 393 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 CGR1YGL029W 363 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RPS20YHL015W 366 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 AGE2YIL044C 897 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 RPS1AYLR441C 768 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 MRPL40YPL173W 894 nt3.78□□□□□ -1.8
SGO1Q08490 ACE2YLR131C 2313 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 NDC80YIL144W 2076 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPN3YER021W 1572 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PPN1YDR452W 2025 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SRD1YCR018C 666 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 INN1YNL152W 1230 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YNL184CYNL184C 327 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YBR062CYBR062C 543 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 AIM4YBR194W 372 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YBR285WYBR285W 435 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SWC4YGR002C 1431 nt3.77□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 KRI1YNL308C 1776 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PSP1YDR505C 2526 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 HNT1YDL125C 477 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PAU10YDR542W 363 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 VFA1YER128W 612 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YGL039WYGL039W 1047 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YGL108CYGL108C 423 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PAU11YGL261C 363 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PAU13YHL046C 363 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 VMA10YHR039C-A 345 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PCL5YHR071W 690 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 GEP4YHR100C 558 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PAU4YLR461W 363 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 CMC2YBL059C-A 330 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 AAR2YBL074C 1068 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YOR331CYOR331C 558 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 DAL5YJR152W 1632 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 EXO5YBR163W 1758 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 NOG1YPL093W 1944 nt3.76□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SYO1YDL063C 1863 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 NSP1YJL041W 2472 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 snR59snR59 78 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 TDA8YAL064C-A 381 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 AFB1YLR040C 675 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YLR224WYLR224W 1110 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 ATX1YNL259C 222 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YOR053WYOR053W 342 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 IDH2YOR136W 1110 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 snR54snR54 86 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 CHL1YPL008W 2586 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SPT6YGR116W 4356 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 BRE5YNR051C 1548 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RAD26YJR035W 3258 nt3.75□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 NCS2YNL119W 1482 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SHE4YOR035C 2370 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SEC53YFL045C 765 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 MTC3YGL226W 372 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 PET54YGR222W 882 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPL40BYKR094C 387 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 YML108WYML108W 318 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 IMP4YNL075W 873 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPL18AYOL120C 561 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 AFT2YPL202C 1251 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 RPC40YPR110C 1008 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 FRM2YCL026C-A 582 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 HEF3YNL014W 3135 nt3.74□□□□□ -1.81
SGO1Q08490 SPC1YJR010C-A 285 nt3.73□□□□□ -1.81
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