Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 TIM9YEL020W-A 264 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 COG2YGR120C 789 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 BAT1YHR208W 1182 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PET191YJR034W 327 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PNO1YOR145C 825 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 GRX7YBR014C 612 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YBR292CYBR292C 372 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 TFC3YAL001C 3483 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 RRP14YKL082C 1305 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 GCV2YMR189W 3105 nt2.1□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YOL057WYOL057W 2136 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YDR186CYDR186C 2634 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YGR168CYGR168C 1131 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 VMA6YLR447C 1038 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 RPN8YOR261C 1017 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 YOR387CYOR387C 621 nt2.09□□□□□ -2.07
NEJ1Q06148 PDR3YBL005W 2931 nt2.09□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SKO1YNL167C 1944 nt2.09□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SLY41YOR307C 1362 nt2.09□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SPP41YDR464W 4308 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 CDC5YMR001C 2118 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 STH1YIL126W 4080 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 TIF35YDR429C 825 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 RPL27BYDR471W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 LSM8YJR022W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YKL070WYKL070W 510 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 CSH1YBR161W 1131 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SWD3YBR175W 948 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YBR201C-AYBR201C-A 204 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 AVT5YBL089W 1380 nt2.08□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 KSP1YHR082C 3090 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YRR1YOR162C 2433 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 TRS130YMR218C 3309 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 snR70snR70 164 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 MFA1YDR461W 111 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 MRPL9YGR220C 810 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 NNF1YJR112W 606 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 PML39YML107C 1005 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YMR099CYMR099C 894 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YNL046WYNL046W 519 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YSF3YNL138W-A 258 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 PEX15YOL044W 1152 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YOL114CYOL114C 609 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YOL134CYOL134C 390 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YOR097CYOR097C 528 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 BAG7YOR134W 1230 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 IRC13YOR235W 315 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 RRG7YOR305W 729 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 MBA1YBR185C 837 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 AIM4YBR194W 372 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 DSE1YER124C 1722 nt2.07□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 AMS1YGL156W 3252 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 POL4YCR014C 1749 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 VAC8YEL013W 1737 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SCY1YGL083W 2415 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YDR124WYDR124W 975 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 FMN1YDR236C 657 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 HLR1YDR528W 1272 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 EMC6YLL014W 327 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 FMP41YNL168C 780 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 TSR4YOL022C 1227 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 KAR4YCL055W 1008 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 AFI1YOR129C 2682 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 STN1YDR082W 1485 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 TOR2YKL203C 7425 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YDR061WYDR061W 1620 nt2.06□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 PEX5YDR244W 1839 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YIL080WYIL080W 4722 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 GCD2YGR083C 1956 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YBR259WYBR259W 2067 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SMC6YLR383W 3345 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 UFD4YKL010C 4452 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YGL159WYGL159W 1113 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YGL218WYGL218W 651 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 RPA12YJR063W 378 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 DGR1YNL130C-A 147 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 GCY1YOR120W 939 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 snR35snR35 204 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 MSH4YFL003C 2637 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YMR046CYMR046C 1323 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 SPB1YCL054W 2526 nt2.05□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 BRE1YDL074C 2103 nt2.04□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 LSM4YER112W 564 nt2.04□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 ARG3YJL088W 1017 nt2.04□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 ALB1YJL122W 528 nt2.04□□□□□ -2.08
NEJ1Q06148 YBL055CYBL055C 1257 nt2.04□□□□□ -2.08
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