Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPN11Q06124 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN11Q06124 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms