Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBE3AQ05086 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBE3AQ05086 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms