Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RELAQ04206 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RELAQ04206 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RELAQ04206 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RELAQ04206 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RELAQ04206 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms