Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCNT1Q02742 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCNT1Q02742 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms