Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1DQ01668 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNA1DQ01668 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms