Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RELBQ01201 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RELBQ01201 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELBQ01201 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELBQ01201 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELBQ01201 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RELBQ01201 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RELBQ01201 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RELBQ01201 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RELBQ01201 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms