Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CACNA1BQ00975 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms