Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3AP98173 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3AP98173 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms