Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ASIC1P78348 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ASIC1P78348 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms